Rodolfo Farlora Zapata

Información básica:

Cargo: Director Instituto de Biología - Profesor Adjunto - Laboratorio de Biotecnología Acuícola y Genómica Reproductiva

Correo electrónico: rodolfo.farlora@uv.cl

Dirección: Avenida Gran Bretaña 1111, Playa Ancha, Valparaíso.

Teléfono: +56-32-2508200 / +56-32-2508489

Formación académica

2024: Diplomado en Innovación y Gestión Tecnológica. Universidad de Valparaíso, Chile.

2012. Doctor en Ciencias Marinas, mención Biociencias Acuáticas, Tokyo University of Marine Science and Technology, Japón.

2009. Master en Ciencias Marinas (MSc), Tokyo University of Marine Science and Technology, Japón.

2003. Biólogo Marino y Licenciado en Biología Marina, Universidad de Valparaíso, Chile.

Docencia

Pregrado

• ZOOLOGIA DE INVERTEBRADOS (LICB 314)
• BIOLOGIA DEL DESARROLLO (LICB 322)
• BIOTECNOLOGIA (LICB 323)
• BIOTECNOLOGÍA MOLECULAR Y BIOLOGÍA REPRODUCTIVA (Electivo)

Postgrado

• ECOLOGÍA MOLECULAR (MBC 102)

Áreas de Investigación / especialidad

• Biotecnología
• Genómica funcional
• Bioinformática aplicada
• Reproducción y desarrollo de organismos acuáticos

Proyectos

• 2023-2024. Director LICHEN: NODOS DE INNOVACIÓN UV 100-INES /Innova UV. Plataforma integral de diseño, evaluación y producción de moléculas bioactivas para la industria agroacuícola. Instituto de Biología, Facultad de Ciencias, Universidad de Valparaíso, Chile.
• 2023-2025. Investigador CONCURSO DE EQUIPAMIENTO CIENTÍFICO Y TECNOLÓGICO MEDIANO FONDEQUIP EQM230165 (ANID). Una plataforma para la prospección de los recursos genómicos de fuentes naturales y de los modelos de estudio en biociencias de la Región de Valparaíso. Instituto de Biología, Facultad de Ciencias, Universidad de Valparaíso, Chile.
• 2022-2024. Director FONDEF IDeA ID21I10276 (ANID). Desarrollo de un antiparasitario biotecnológico para el tratamiento del piojo de mar en la salmonicultura. Facultad de Ciencias/ Facultad de Farmacia, Universidad de Valparaíso (Beneficiaria principal). Facultad de Ciencias Químicas y Farmacéuticas, Universidad de Chile (Otra beneficiaria).
• 2022-2023. Co-investigador NODOS DE INNOVACIÓN UV 100-INES /Innova UV. Plataforma para el escalamiento de productos biotecnológicos de origen microbiano con aplicación en salud humana, animal y medio ambiente: una estrategia One Health. Instituto de Biología, Facultad de Ciencias, Universidad de Valparaíso, Chile.
• 2019-2023. Co-Investigador FONDECYT 1200129 (Regular) (ANID): Unraveling scallop immunity – pathogen interplay by dual transcriptomics: Identification of molecular markers associated with resistance in larvae and virulence in a pathogenic Vibrio. Instituto de Biología, Facultad de Ciencias Biológicas, Pontificia Universidad Católica de Valparaíso, Chile.
• 2015-2018. Investigador principal (PI) FONDECYT 11150915 (Iniciación): Molecular regulation of gonad development and reproductive output in the sea lice Caligus rogercresseyi: functional assessment of target genes and prospects for parasite control. Instituto de Biología, Facultad de Ciencias, Universidad de Valparaíso, Chile.
• 2015-2016. Investigador postdoctoral, centro FONDAP 15110027 (INCAR): Regulación de microRNAs y sus genes target asociados a crecimiento muscular en lenguado Paralichthys adspersus. Laboratorio de Biotecnología Molecular, Universidad Andrés Bello, Chile.
• 2012-2015. Investigador responsable FONDECYT 3130446 (Postdoctorado): Patrones de expresión de microRNAs e identificación de SNPs asociados al proceso de maduración gonadal en la trucha arcoiris Oncorhynchus mykiss. Centro de Biotecnología, Universidad de Concepción, Chile.
• 2000-2006. Investigador junior/investigador asociado, Facultad de Ciencias, Universidad de Valparaíso, Chile. Desarrollo de técnicas de cultivo en almejas nativas (Proyecto FONDEF D98I1081), su escalamiento productivo (FONTEC 202-3032) y transferencia tecnológica (FONDEF D01T1013).

Publicaciones

• Jorquera A, Montecinos C, Borregales Y, Muñoz-Cerro K, González R, Santelices M, Rojas R, Mercado L, Ramírez F, Guzmán F, Farlora R, Valenzuela C, Brokordt K and Schmitt P. 2024. A novel LPS binding/bactericidal permeability-increasing protein (LBP/BPI) from the scallop Argopecten purpuratus plays an essential role in host resistance to Vibrioinfection. Fish & Shellfish Immunology 154:109989. https://doi.org/10.1016/j.fsi.2024.109989
• Bustos P, Vidal-Pérez D, Schmitt P, Brown DI, and Farlora R. 2023. Silencing of the Vasa gene by RNA interference affects embryonic development and reproductive output in the sea louse Caligus rogercresseyi. Marine Biotechnology 25(4): 612–623. https://doi.org/10.1007/s10126-023-10232-5
• Jeria E, Oyanedel D, Rojas R , Farlora R, Lira G, Mercado A, Muñoz K , Destoumieux-Garzón D, Brokordt K, and Schmitt P. 2023. Resistance of Argopecten purpuratus scallop larvae to vibriosis is associated with the front-loading of immune genes and enhanced antimicrobial response. Frontiers in Immunology 14:1150280. https://doi.org/10.3389/fimmu.2023.1150280
• Bustos P, Vidal-Pérez D, Schmitt P, Brown DI, and Farlora R. 2023. RNA interference-mediated silencing of Retinoid X Receptor causes reproductive failure in the sea lice Caligus rogercresseyi. Aquaculture 566, 739170 https://doi.org/10.1016/j.aquaculture.2022.739170
• Tapia D, Kuznar J, Farlora R and Yáñez JM. 2021. Differential transcriptomic response of rainbow trout to infection with two strains of IPNV. Viruses 14(1):21. https://doi.org/10.3390/v14010021
• Morales-Moya V, Stambuk F, Farlora R, Guzmán F, Mercado L, Brokordt K & Schmitt P. 2021. Molecular characterization and cellular localization of a transmembrane C-type lectin receptor in hemocytes from the scallop Argopecten purpuratus. Aquaculture 546: 737293 DOI: https://doi.org/10.1016/j.aquaculture.2021.737293
• Hidalgo-Cabrera, A., Bustos, P., Vidal-Pérez, D., Schmitt, P., Brown, D.I. and Farlora, R. 2021. Analysis and gonadal localization of Speedy A, a novel gene associated with early germline cells in the scallop Argopecten purpuratus. Animal Reproduction Science. https://doi.org/10.1016/j.anireprosci.2021.106909
• Flores-Herrera P, Farlora R, González R, Brokordt K, Schmitt P. 2019. De novo assembly, characterization of tissue-specific transcriptomes and identification of immune related genes from the scallop Argopecten purpuratus. Fish and Shellfish Immunology. DOI: https://doi.org/10.1016/j.fsi.2019.03.069
• Donoso A, Valdés J, Sanhueza N, Aguilar A, Farlora R, Miguez J, Tort L, Valdés Juan A, Boltaña S. 2018. Thermal modulation of monoamine levels influence the fish stress and welfare. Frontiers in Endocrinology. DOI: https://doi.org/10.3389/fendo.2018.00717
• Valenzuela-Miranda D, Valenzuela-Muñoz V, Farlora R, Gallardo-Escárate C. 2017. MicroRNA-based transcriptomic responses of Atlantic salmon during infection by the intracellular bacterium Piscirickettsia salmonis. Developmental and Comparative Immunology 77: 287-296. https://doi.org/10.1016/j.dci.2017.08.016
• Farlora R, Valdebenito-Aguayo F, Valenzuela-Muñoz V, Gallardo-Escárate C. 2017. Hydrogen peroxide treatment modulates the transcription of sex-related genes in the sea lice Caligus rogercresseyi. Journal of Fish Diseases 41: 921-926 http://dx.doi.org/10.1111/jfd.12700
• Gallardo-Escarate C, Valenzuela-Muñoz V, Boltaña S; Nuñez-Acuña G, Valenzuela-Miranda D; Ana Gonçalves AT, Détrée C, Tarifeño-Saldivia E, Farlora R, Roberts S, Putnam H. 2017. The Caligus rogercresseyimiRNome: discovery and transcriptome profiling during the sea lice ontogeny. Agrigene 4: 8-22. http://dx.doi.org/10.1016/j.aggene.2017.03.002
• Farlora R, Valenzuela-Muñoz V, Chávez-Mardones J and Gallardo-Escárate C. 2016. Aquaporin family genes exhibit developmentally-regulated and host-dependent transcription patterns in the sea louse Caligus rogercresseyi. Gene 585(1): 119-127. http://dx.doi.org/10.1016/j.gene.2016.03.035
• Farlora R, Valenzuela-Miranda D, Alarcón-Matus P, Gallardo-Escárate C. 2015. Identification of microRNAs associated with sexual maturity in rainbow trout brain and testis through small RNA deep sequencing. Molecular Reproduction and Development 82(9): 651-662. http://dx.doi.org/10.1002/mrd.22499
• Farlora R, Nuñez-Acuña G, Gallardo-Escárate C. 2015. Prohibitin-2 gene reveals sex-related differences in the salmon louse Caligus rogercresseyi. Gene 564 (1): 73-80. http://dx.doi.org/10.1016/j.gene.2015.03.045
• Farlora R, Araya-Garay J, Gallardo-Escárate C. 2014. Discovery of sex-related genes through high-throughput transcriptome sequencing from the salmon louse Caligus rogercresseyi. Marine Genomics 15: 85-93. http://dx.doi.org/10.1016/j.margen.2014.02.005
• Valenzuela-Miranda D, Gallardo-Escárate C, Valenzuela-Muñoz V, Farlora R, Gajardo G. 2014. Sex-dependent transcriptome analysis and single nucleotide polymorphism (SNP) discovery in the brine shrimp Artemia franciscana. Marine Genomics 18 (part B): 151-154. http://dx.doi.org/10.1016/j.margen.2014.10.007
• Gonçalves AT, Farlora R& Gallardo-Escárate C. 2014. Transcriptome survey of lipid metabolic pathways involved in energy production and ecdysteroids synthesis of the salmon louse Caligus rogercresseyi (Crustacea: Copepoda). Comparative Biochemistry and Physiology B 176: 9-17. http://dx.doi.org/10.1016/j.cbpb.2014.07.002
• Farlora R, Hattori-Ihara S, Takeuchi Y, Hayashi M, Octavera A, Alimuddin and Yoshizaki G. 2013. Intraperitoneal germ cell transplantation in the Nile tilapia Oreochromis niloticus. Marine Biotechnology. 16(3): 309-320. http://dx.doi.org/10.1007/s10126-013-9551-y
• Aguilar-Espinoza A, Valderrama-Aravena N, Farlora R, De la Cruz FL and Gallardo-Escárate C. 2013. Development of novel polymorphic EST-SSR markers in Californian abalone Haliotis rufescensand genetic analysis in wild and hatchery-bred populations. Aquaculture Research 45(12): 1942-1952. http://dx.doi.org/10.1111/are.12141
• Farlora R, Kobayashi S, França LR, Batlouni SR, Lacerda SMSN and Yoshizaki G. 2009. Expression of GFP in transgenic tilapia under the control of the medaka ß-actin promoter: establishment of a model system for germ cell transplantation. Animal Reproduction 6: 450-459.